BIO-RAD CFX Maestro(定量PCR数据处理大师)

　　CFX Maestro提供PCR数据分析功能，您可以在软件加载数据执行图形化分析，将数据显示在条形图，簇图，散点图，热图或火山图，让您可以更直观的查看分析结果，软件启动以后会显示引导界面，您可以按照官方提示的引导流程创建数据分析项目，结合板功能就可以执行各种分析，CFX Maestro软件提供了两个创建板的选项：用于实时PCR运行的板编辑器和用于标准化基因表达分析的设置向导，编辑器包含分配给平板孔的标准荧光团和样品类型，能够设置参考靶标和对照样品以进行基因表达分析，能够在运行前，运行中或运行后编辑印版设置，能够保存印版文件以供重复使用，能够将印版文件打印到默认打印机，如果你需要这款软件就下载吧！

软件功能

　　CFX Maestro软件是一种易于学习且易于使用的综合工具套件，用于收集和分析来自CFX系列实时PCR系统的实时PCR数据。 CFX Maestro软件简化了板的设置，数据收集，数据分析以及实时PCR数据的数据可视化的过程。

　　CFX Maestro软件的主要功能：

　　1、数据统计分析-t检验和单向方差分析

　　2、高分辨率图形和数据可视化工具-以多种格式查看数据，包括条形图，箱须图，聚类图和火山图，然后编辑和注释图，编辑颜色并以任何分辨率导出

　　3、设计复杂的实验-使用技术复制品和生物学组设置您的印版，并使用颜色编码的印版布局轻松查看您的分组和复制

　　4、参考基因选择工具-查看基因稳定性，以快速确定最稳定的参考基因以用于您的测定

　　5、多板研究分析-将多个运行分组在一起，一次分析多板研究中的所有数据

　　6、PrimePCR™分析集成-通过将PrimePCR运行文件拖放到CFX Maestro中，导入PrimePCR板图和运行条件，然后使用随附的控件快速执行运行的质量控制

软件特色

　　使用CFXMaestro软件，您可以执行以下操作：

　　使用启动向导快速轻松地设置实时PCR实验。

　　使用条形图，簇图，散点图，热图或火山图分析数据，以便快速解释和理解您的结果。

　　自定义您的数据表示形式并导出高分辨率图以进行发布和报告生成。

　　使用PrimePCR分析控件确定RNA质量并排除实验故障。

　　选择合适的参考基因并使用参考基因选择工具分析其稳定性。

　　进行统计分析，包括单向ANOVA基因表达分析。

　　自动生成每个合格/不合格结果的PDF报告，以帮助评估仪器的性能。

安装方法

　　1、打开CFXMaestroSetupV4.1.exe直接安装，点击install

　　2、提示软件的安装进度条，等待软件安装结束

　　3、安装结束会打开BIO-RAD CFX Maestro

　　4、提示协议自动写程序...Ta计算器...染料校准向导、重新安装仪器驱动程序

　　5、现在软件就可以正常使用

官方教程

　　主窗口

　　CFX Maestro软件将打开“主页”窗口并显示“启动向导”，您可以从中设置实验，执行或重复运行或分析现有运行。 在“主页”窗口中，您还可以查看应用程序和仪器日志，创建和管理用户以及访问多个有用的工具

　　插入渐变步骤

　　1.确认梯度板的大小与仪器的块类型（96孔或384孔）相同。

　　2.如果尚未这样做，请选择用于梯度的板尺寸：选择“工具”>“梯度计算器”，然后从下拉列表中选择适当的孔类型。

　　3.在工具栏上，从“插入步骤”下拉列表中选择“之前”或“之后”。

　　4.在图形或轮廓窗格中，选择计划插入梯度步骤之前或之后的步骤。

　　5.在左窗格中，单击“插入渐变”。 新的渐变步骤在图形和轮廓窗格中突出显示，例如：

　　插入融化曲线步骤

　　提示：您不能在GOTO循环中插入熔解曲线步骤。 注意：熔解曲线步骤在步骤开始时保持30秒钟，该步骤未在方案中显示。

　　插入熔解曲线步骤

　　1.在工具栏上，从“插入步骤”下拉列表中选择“之前”或“之后”。

　　2.在图形中，选择计划插入熔融曲线步骤之前或之后的步骤。

　　3.在左窗格中，单击“插入熔融曲线”。 新的熔解曲线步骤在图形和轮廓窗格中突出显示，例如：

　　4.要编辑熔融温度范围或增量时间，请在图形或轮廓窗格中选择默认值，然后输入新值。

　　5.单击确定，然后单击是保存更改。

　　添加或删除印版读取步骤

　　提示：将印版读取命令添加到步骤后，选择步骤后，该按钮将变为“ Remove Plate Read”。

　　向步骤添加印版

　　1.在工具栏上，从“插入步骤”下拉列表中选择“之前”或“之后”。

　　2.在图形上，选择计划插入印版读取步骤之前或之后的步骤。

　　3.在左窗格中，单击“将板读取添加到步骤”以将板读取添加到所选步骤。

　　4.单击确定，然后单击是保存更改。

　　删除从步骤中读取的印版

　　在图形上，选择包含印版读数的步骤，然后在左窗格中单击“删除印版读数”。

　　更改步骤选项

　　更改所选步骤的步骤选项

　　1.在图形或轮廓窗格中选择目标步骤。

　　2.在左窗格中，单击“步骤选项”以打开“步骤选项”对话框。或者，在任一窗格中右键单击目标步骤，然后在出现的菜单中选择“步骤选项”。

　　3.要添加，修改或删除选项：

　　在适当的文本框中输入一个值。

　　在特定的文本框中编辑一个值。

　　选择或清除复选框。

　　4.单击确定保存更改，然后关闭“步骤选项”对话框。

　　5.单击确定，然后单击是保存协议。

　　删除步骤

　　重要：您不能撤消此功能。 删除步骤时请多加注意。

　　删除协议中的步骤

　　1.在图形或轮廓窗格中选择步骤。

　　2.在左窗格中，单击“删除步骤”以删除所选步骤。

　　3.单击确定，然后单击是保存协议。

　　复制，导出或打印协议

　　复制协议

　　右键单击协议大纲，然后选择“复制协议”。

　　您可以将轮廓粘贴到.txt，.xls，.doc或.ppt文件中。

　　导出协议

　　1.右键单击协议大纲，然后选择导出协议。 出现另存为对话框。

　　2.（可选）在Windows资源管理器中，导航到要在其中保存协议文件的文件夹。

　　3.在“文件名”中，为导出的协议文件键入一个名称。

　　4.单击保存。 打印协议

　　右键单击协议大纲，然后选择“打印”。

　　您可以将协议大纲打印到默认打印机。

　　使用Protocol AutoWriter创建协议

　　重要提示：伯乐公司不保证运行通过Protocol AutoWriter创建的协议时，始终会产生PCR产物。

　　CFX Maestro的Protocol AutoWriter会根据以下输入参数自动生成循环协议：

　　扩增子长度-PCR产物的预期长度

　　退火温度-所用引物的反应Ta如果未知，则可以使用Ta计算器根据引物序列自动计算出Ta。注意：根据引物的解链温度（Tm）信息调整Ta，该信息基于所选的酶和操作规程速度。

　　酶类型-DNA聚合酶（iTaq™，iProof™DNA聚合酶或其他），如果您使用iTaq或iProof DNA聚合酶以外的酶，则可以输入其他信息，包括梯度范围，热启动激活时间（以秒），以及最终扩展时间（以秒为单位）。

　　运行速度-反应速度（标准，快速或超快）

　　Protocol AutoWriter协议根据所选的速度设置来优化协议。总运行时间由步骤和循环数，每个步骤的孵育时间以及在目标温度下达到均一性所需的时间确定。

　　使用输入的参数和标准PCR指南，Protocol AutoWriter会自动生成具有热启动，初始变性，退火和延伸步骤的自定义PCR协议。然后，您可以查看建议的协议的图形表示并编辑，运行或保存协议

　　使用CFX Maestro的Protocol AutoWriter创建新协议

　　1.在主窗口中，选择工具>协议自动写程序。

　　出现“协议自动写程序”对话框。

　　2.在“输入目标值/酶”部分中，执行以下操作：

　　输入底漆的退火温度（Ta）（如果已知）。

　　以碱基对（bp）为单位输入扩增子长度。

　　从选项列表中选择一种酶类型（iTaq™DNA聚合酶，iProof™DNA聚合酶或其他）。

　　提示：如果选择“其他”作为酶类型，则“其他参数（可选）”部分中的参数将变为活动状态。

　　3.如果选择其他作为酶类型，则可以将以下任何或所有以下参数添加到方案中：

　　渐变范围

　　热启动激活温度

　　最终延长时间

　　4.在“类型”部分中，移动滑动条以选择协议速度（“标准”，“快速”或“超快”）。 CFX Maestro会调整总运行时间。

　　5.选择要执行的PCR类型（默认为实时PCR）。 通过实时PCR，CFX Maestro增加了板读取步骤来收集荧光数据。

　　6.在“预览”部分中，查看协议。 您可以根据需要进行更改。

　　7.请执行以下一项操作：

　　单击确定以保存新协议。 保存后，该协议将在“启动向导”中打开。 单击“编辑所选内容”以对协议进行任何更改。 例如，您可能需要更改盖子温度和样品量。

　　单击取消关闭窗口而不保存协议。

　　使用Ta计算器

　　1.要打开Ta计算器，请执行以下任一操作：

　　如果您当前在Protocol AutoWriter中，请单击Ta计算器。

　　在主窗口中，选择工具>计算器。 将出现Ta计算器对话框。

　　2.在正向引物文本框中，键入或粘贴正向引物序列。

　　提示：您也可以使用对话框左侧的A，T，G，C按钮输入序列。

　　3.在“反向引物”文本框中键入或粘贴反向引物序列。

　　4.单击计算。

　　Ta计算器计算并显示每个引物的Tm以及平均Tm和Ta值，例如：

　　如果引物Tm值相差超过4°C，Protocol AutoWriter会使用较低的引物Tm值+ 2°C作为计算Ta值的基础，您可以通过改变酶和反应速度来进一步对其进行修改。 Ta计算器使用iTaq DNA聚合酶生成用于标准速度的退火温度。 当使用其他酶时，速度设置会自动调整Ta。

　　5.请执行以下一项操作：

　　如果您从协议自动写程序中打开Ta计算器，请单击“确定”。 您将返回到协议自动写程序。 退火温度会自动修改。

　　如果从“工具”菜单中打开了Ta计算器，请记录计算并单击“取消”关闭计算器。

　　通过启动向导打开新的板文件

　　1.在主窗口中，执行以下操作之一以打开“启动向导”（如果不在视图中）：

　　选择查看>启动向导。

　　单击工具栏上的启动向导。默认情况下，“启动向导”显示“运行设置”选项卡，并选择了CFX96™仪器。

　　2.如有必要，从下拉列表中选择仪器类型。

　　3.要创建新的板，请单击“用户定义”作为运行类型。将打开“运行安装程序”对话框，其中显示“协议”选项卡。

　　4.单击板选项卡，然后单击新建。

　　板编辑器窗口打开，显示所选仪器的默认板布局。

　　从“运行设置”对话框中打开新的板文件

　　1.在主窗口中，执行下列操作之一以打开“运行安装程序”对话框：

　　选择运行>用户定义的运行。

　　单击工具栏上的“用户定义的运行设置”。

　　“运行设置”对话框将打开“协议”选项卡。

　　2.要创建新的板，请单击“板”选项卡，然后单击“新建”。

　　板编辑器窗口打开，显示所选仪器的默认板布局。

　　在印版编辑器中打开现有的印版文件

　　CFX Maestro软件提供了样品板文件，您可以编辑并另存为新板。您也可以从以前保存的板文件创建新的板文件。打开样品板文件

　　1.在主窗口中，选择文件>打开>平板。

　　Windows资源管理器将打开CFX Maestro示例文件文件夹的位置。

　　2.打开“样品文件”文件夹，然后打开“板”文件夹。

　　3.选择选择的板，然后单击“打开”。样品板文件在“板编辑器”窗口中打开。

　　4.选择文件>另存为，然后使用新名称或新文件夹保存板文件。

　　打开以前保存的板文件

　　1.在主窗口中，执行下列操作之一：

　　选择“文件”>“打开”>“板”，导航至并选择目标板，然后单击“打开”。

　　打开启动向导，然后执行以下操作之一：

　　要编辑现有印版文件，请单击“选择现有文件”并导航到目标文件。

　　要编辑显示的印版文件，请单击“编辑选定对象”。

　　目标板在“板编辑器”窗口中打开。

　　2.选择文件>另存为，然后使用新名称或新文件夹保存板文件。